碘酒由於碘酒的刺激性較大，應避免局部大劑量、大面積地使用，否則會造成難以忍受的劇烈疼痛。眼、鼻、口腔等部位粘膜嬌嫩，構造特殊，不可直接使用。只有復方碘溶液（含5％碘和10％碘化鉀的水溶液）刺激性小，可用作粘膜的消毒。

化膿性傷口，因膿性分泌物和傷口內部的脂肪會與碘起反應，生成化學合成物而使其失效，所以不可直接使用。而且，碘酒不得與紅藥水同時混擦，以免碘與汞反應生成劇毒的碘化汞，不僅失去了殺菌作用，而且會腐蝕皮膚引起潰爛，甚至在吸收過多後會引起汞中毒。

尤其應注意的是，對碘高度過敏的人可引起嚴重的發熱與全身性皮疹反應，應禁止使用！

酒精除消毒外，高熱病人，用50％濃度的酒精擦拭血管豐富的腋下、頸部、胸窩、腹股間以及四肢等部位，有利於散熱，起到物理降溫作用；用酒精擦拭長期臥床病人易受壓部位的皮膚，可促進局部血液循環，防止皮膚因長期受壓形成褥瘡。但酒精有破壞細胞和較強的刺激性，故不能用於傷口內、破潰部位以及眼、鼻、口、陰道等部位粘膜的消毒。另外，酒精貯藏的容器應嚴密，用後瓶口應塞緊，防止揮發造成含量下降影響殺菌效力。