全病毒滅活疫苗、裂解疫苗和亞單位疫苗的成分都沒有感染性，不會引起流感。

這些疫苗接種有可能發生與疫苗無關的偶合性呼吸道疾病，接種後注射部位會出現短暫的輕微疼痛、紅腫，全身可能發生低熱、不適。一般只需對症處理，不會影響疫苗效果。衛生部在《中國流行性感冒疫苗預防接種指導意見（試行）》的通知中特別強調，雞蛋蛋白高度過敏者注射疫苗後可發生急性超敏反應。