首先，活動性肝炎的患者不宜使用降膽固醇的藥物。因為這類降脂藥物在肝臟代謝，因而可加重肝臟的損害。
其次，懷孕或哺乳期婦女不宜使用降膽固醇藥物。因為動脈粥樣硬化是慢性過程，所以妊娠期停用降脂藥物對治療原發性高膽固醇血症的遠期效果影響甚少；而且，膽固醇及其生物合成途徑的其它產物是胎兒發育的必需成分，包括類固醇和細胞膜的合成。他訂類降脂藥物在降低膽固醇生物合成的同時，也減少了膽固醇生物合成通路的其它產物。所以孕婦服用這類降血脂藥物可能有損於胎兒。
降血脂藥物及其代謝產物是否經人乳分泌，目前還缺乏研究。由於許多藥物經人乳分泌，而且因降脂藥物潛在的副作用，因此哺乳期婦女不宜服用降脂藥物。
最後，必須強調，並非所有的冠心病患者都適合進行降低膽固醇的治療，70歲以上高齡的老年患者，慢性充血性心力衰竭、癡呆、晚期腦血管疾病或活動性惡性腫瘤的患者，都不宜採取降脂治療。